1951年，秦詒純受英商藝明洋行之聘，到天津、青島等地為中國(guó)人民解放軍架設(shè)第一批國(guó)防雷達(dá)3座。竣工后，為人民政府所挽留。

1952年10月起，秦詒純?cè)谥袊?guó)科學(xué)院上海分院生理生化研究所電子室任主任，前后共30多年。期間。配合神經(jīng)生理學(xué)科對(duì)各種生理儀器如聲光刺激器、放大器、示波器、平均儀和心電遙測(cè)電子儀等的研制方面，作出了很大成績(jī)，曾多次獲得獎(jiǎng)勵(lì)。我國(guó)第一位女登山運(yùn)動(dòng)員潘多登上珠穆朗瑪峰時(shí)佩帶的心電遙測(cè)儀就是他主持研制的。1956年，在秦詒純主持下，研制成功全套電生理儀器，它能把人體內(nèi)微小的10微伏特的電位變化，放大200萬(wàn)倍以上，然后顯示在儀器中間的示波器上，刺激器又可以產(chǎn)生各種不同的方形電波，從而對(duì)電生理的研究作出了重大貢獻(xiàn)。70年代后期起，還曾和復(fù)旦大學(xué)協(xié)作研制成我國(guó)第一臺(tái)生物醫(yī)學(xué)專用計(jì)算機(jī)，與中山醫(yī)院協(xié)作研制了心電起搏儀，指導(dǎo)和支持瞳孔調(diào)節(jié)規(guī)律和三自由度假肢等項(xiàng)研究。1982年秋，應(yīng)英國(guó)皇家學(xué)會(huì)邀請(qǐng)，去英國(guó)講學(xué)。

秦詒純是中國(guó)電子學(xué)會(huì)生物醫(yī)學(xué)電子學(xué)學(xué)會(huì)主任委員，中國(guó)生物學(xué)工程學(xué)會(huì)副理事長(zhǎng)，生物電子學(xué)高級(jí)工程師，是中國(guó)生物電子學(xué)的帶頭人。

1984年12月，秦詒純因心肌梗塞，搶救無(wú)效，與世長(zhǎng)逝。