舊為「寶山巖」，俗稱「董內(nèi)巖」，始建于明朝萬(wàn)歷年間。相傳有當(dāng)?shù)貐切沾迕裨诖司虻氐脤�，即營(yíng)建巖寺，是為「寶山巖」和「董內(nèi)巖」名稱之由來(lái)。巖側(cè)原有泉水清冽，據(jù)傳宋幼主從此經(jīng)過(guò)，曾掬泉止渴，乃稱為「圣泉」，為禾山四大名泉之一。

巖泉于清初兵燹�？滴醵�十五年（一六八六年），有同安寺光隱和尚居此重興寺巖，并就地購(gòu)置寺田，與門徒耕耘自食，篤修圣道，并于巖側(cè)勒石告誡諸徒：「嚴(yán)守田產(chǎn)，持行農(nóng)禪，躬耕力食，不與世人爭(zhēng)利�！骨迥┟癯�，殿堂因蟻蟲(chóng)蛀蝕傾危，蔣以德居士及地方董事集資于高昂地帶重建大殿及僧舍寮房。

一九四九年后，寺院一度駐扎軍隊(duì)，上世紀(jì)八十年代末部隊(duì)撤離，由廈門市佛教協(xié)會(huì)接管，并由南普陀寺及閩南佛學(xué)院募建，作為閩南佛學(xué)院女眾分院學(xué)舍。一九九一年動(dòng)工興建，一九九七年年落成。學(xué)院女眾入遷，并改稱紫竹林寺。一九九八年八月舉行落成開(kāi)光典禮。

紫竹林寺現(xiàn)任住持圣輝法師，48歲，師從仁德法師，畢業(yè)于中國(guó)佛學(xué)院研究生班，兼任中國(guó)佛教協(xié)會(huì)副會(huì)長(zhǎng)，南普陀寺方丈，閩南佛學(xué)院院長(zhǎng)，南普陀寺慈善基金會(huì)會(huì)長(zhǎng)，廈門市佛教協(xié)會(huì)名譽(yù)會(huì)長(zhǎng)。

閩南佛學(xué)院現(xiàn)有法師、教授總計(jì)80名，其中男眾法師有23名，女眾法師33名，聘請(qǐng)社會(huì)其他大學(xué)兼職教授24名。

閩南佛學(xué)院學(xué)員都是來(lái)自全國(guó)各地寺院的出家眾。學(xué)員須具有高中或相當(dāng)于高中文化程度，年齡在十八歲至三十歲之間，經(jīng)過(guò)統(tǒng)一考試，擇優(yōu)錄取。

現(xiàn)有預(yù)科男、女眾學(xué)僧79人，本科男、女眾學(xué)僧214人，至2009年6月已畢業(yè)十一屆本科生，共計(jì)畢業(yè)男女學(xué)僧859名，分赴各地佛學(xué)院任教，或管理寺院，或在各地佛教會(huì)任職，更有不少優(yōu)秀學(xué)員遠(yuǎn)渡重洋，到歐美及南洋等地弘揚(yáng)佛法和求學(xué)深造。

閩南佛學(xué)院的標(biāo)志設(shè)計(jì)，是以五瓣蓮花和之上的炬光為主體，背景由日月相匯聚所

形成的月形為造型而構(gòu)成。在標(biāo)志的設(shè)計(jì)元素中：“炬光”象征著傳燈、教育和智慧，與佛學(xué)院的職能相應(yīng)；蓮花和日月體現(xiàn) “悲智”，與學(xué)院院訓(xùn)的理念相應(yīng)；蓮花的五片花瓣象征五老峰，與學(xué)院的所在地相應(yīng)。整個(gè)標(biāo)志的設(shè)計(jì)簡(jiǎn)潔，大方，易記。在展現(xiàn)閩南佛學(xué)院獨(dú)特文化個(gè)性的同時(shí)，也充分體現(xiàn)了閩南佛學(xué)院在新時(shí)代背景下，契理契機(jī)，順應(yīng)時(shí)代發(fā)展的需要，是閩南佛學(xué)院對(duì)外傳播的最為重要視覺(jué)符號(hào)之一。