吳常信的研究成果有8項獲得國家級獎勵，6項獲得省部級獎勵。1981年回國以來已發(fā)表論文100余篇，其中有20篇論文分別在17次國際會議上發(fā)表；獲國家和省部級技術(shù)改進(jìn)、科技進(jìn)步、科技推廣、科技情報等獎勵14項，其中國家級獎8項，省部級獎6項。并多次應(yīng)邀在國內(nèi)外學(xué)術(shù)會議上作專題報告。到2004年已培養(yǎng)博士生45名，碩士生40名。

　　吳常信教授治學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)、教書育人，由于在教學(xué)和科學(xué)研究中成績顯著，在1984年被評為“國家級有突出貢獻(xiàn)中青年專家”；1991年榮獲國務(wù)院頒發(fā)的“為發(fā)展我國高等教育事業(yè)做出突出貢獻(xiàn)”證書。同年被國務(wù)院評為享受“政府特殊津貼”專家。同年，由中組部、中宣部、國家教委、共青團(tuán)中央和全國教育工會五單位聯(lián)合授予“全國普通高校優(yōu)秀思想政治工作者”稱號。吳常信院士主持的“節(jié)糧小型蛋雞育種”和“畜禽遺傳資源保存的理論與技術(shù)”分別于1999年和2001年獲國家科技進(jìn)步二等獎；他參加的“豬繁殖力的DNA標(biāo)記”于2001年獲美國專利局專利，又于2003年獲國家發(fā)明二等獎。

　　吳常信長期從事動物遺傳理論與育種實踐研究。在選種理論中，首次提出了“數(shù)量性狀隱性有利基因”的假設(shè)，并通過實驗得到證實。在參數(shù)估測中，首次提出多胎動物“混合家系”的概念，推導(dǎo)了計算混合家系親緣相關(guān)的理論與近似公式，這在改進(jìn)遺傳參數(shù)估測方法上是一種創(chuàng)新，提高了選種的準(zhǔn)確性。在蛋雞育種中，應(yīng)用合成系育種的理論與方法，解決了我國蛋雞育種由于長期閉鎖選育造成的遺傳進(jìn)展緩慢的問題，取得了明顯的經(jīng)濟(jì)效益和社會效益。在動物遺傳資源的研究中，系統(tǒng)解決了保種群體大小、性別比例、世代間隔、近交程度、選擇作用等一系列群體遺傳學(xué)的理論與方法問題，提出了“優(yōu)化保種設(shè)計”。近年來主持完成的“節(jié)糧小型蛋雞的選育”項目，在國際上首先實現(xiàn)小型蛋雞產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)。

　　 一、北京白雞純系與配套系的選育(1976～1985)

　　吳常信教授是該項目的主持人之一。他的主要貢獻(xiàn)是制訂北京白雞的育種方案，進(jìn)行育種理論和技術(shù)指導(dǎo)，解決了從商品雞中育成純系和配套系的理論與方法。經(jīng)過9年7個世代的系統(tǒng)選育，育成了生產(chǎn)性能高、生活力強(qiáng)、遺傳性能穩(wěn)定的我國優(yōu)良白殼蛋雞種。到1985年鑒定時，已在國內(nèi)推廣6000多萬只，經(jīng)濟(jì)效益達(dá)2．12億元。該項成果已獲1986年北京市人民政府科技進(jìn)步一等獎。1991年又獲國家星火一等獎。

　　 二、中國美利奴羊新品種的選育(1983～1995)

　　這是“六五”國家科技攻關(guān)項目。吳常信教授是內(nèi)蒙古良種細(xì)毛羊育種協(xié)作組的成員，是“良種細(xì)毛羊主要經(jīng)濟(jì)性狀遺傳參數(shù)的計算與應(yīng)用”課題的主持人，建立了我國第一個綿羊育種資料數(shù)據(jù)庫，進(jìn)行了細(xì)毛羊主要經(jīng)濟(jì)性狀的育種參數(shù)計算，對種公羊做出育種值排隊和制訂了選擇指數(shù)。1985年“中國美利奴羊新品種育成”項目通過鑒定，1987年該項目獲國家科技進(jìn)步一等獎。

　　 三、中國黑白花奶牛育種(1972～1985)

　　主要參加北京地區(qū)黑白花奶牛的育種工作，對北京市種公牛進(jìn)行了育種值的計算，提出了公牛后裔鑒定方案和種子母牛的選配計劃。他也是北方黑白花奶牛育種協(xié)作組成員，北方地區(qū)黑白花奶牛品種標(biāo)準(zhǔn)化工作的主要負(fù)責(zé)人，1976年提出“北方黑白花奶牛品種標(biāo)準(zhǔn)”。“中國黑白花奶牛的培育”項目已于1987年獲農(nóng)業(yè)部科技進(jìn)步一等獎；1988年又獲國家科技進(jìn)步一等獎。

　　 四、畜禽遺傳規(guī)律及其應(yīng)用(1979～1984)

　　吳常信教授是該項目的主要參加人和組織者之一，他的主要貢獻(xiàn)是在我國首次提出了多胎動物“混合家系”的概念，推導(dǎo)了混合家系親緣相關(guān)的計算公式，改進(jìn)了遺傳參數(shù)的估計方法，提高了多胎動物選種的準(zhǔn)確性。該項目于1984．年獲農(nóng)牧漁業(yè)部技術(shù)改進(jìn)一等獎。

　　 五、蛋雞合成系育種的理論與實踐(1986～1995)

　　主要成就是提出蛋雞合成系選育的理論與方法。由他主持的蛋雞攻關(guān)課題，在“六五”期間育成“農(nóng)昌2號”淺褐殼蛋雞；在“七五”期間育成“農(nóng)昌1號”褐殼蛋雞。這兩個雞種不但分別達(dá)到了“六五”和“七五”國家蛋雞攻關(guān)指標(biāo)，而且在產(chǎn)蛋總重量和飼料轉(zhuǎn)化率上都居全國參加測定的各組之首。特別是“農(nóng)昌l號”還超過同期測定的國外褐殼蛋雞良種“星雜579"的產(chǎn)蛋水平。他主持的國家科技攻關(guān)課題“蛋雞育種的理論與實踐”的研究結(jié)果，豐富和發(fā)展了蛋雞育種的理論體系，突破了傳統(tǒng)理論中“閉鎖”和“純”的觀點的束縛，解決了我國蛋雞育種長期閉鎖群選育造成的遺傳進(jìn)展緩慢的問題。該項成果于1992年獲農(nóng)業(yè)部科技進(jìn)步二等獎。

　　 六、節(jié)糧小型蛋雞的選育(1990～1997)

　　該項目經(jīng)過8年的選育，成功地將肉雞中的小型(dw)基因引入到中型褐殼蛋雞，育成了小型蛋雞純系。用這種小型雞作父本與普通型蛋雞雜交，后代商品雞為矮小型。與普通蛋雞相比，小型雞的體重小20％～25％，可提高飼養(yǎng)密度25％～30％。在一個產(chǎn)蛋周期中(72周齡)，雖然5,-／~u2018l一1．2kg的雞蛋，但可節(jié)省8～10kg飼料。每只小型雞可比普通蛋雞增加收入8～10元，料蛋比達(dá)到2．1：1，超過了國際上目前優(yōu)秀普通型蛋雞測定站測定的水平，對我國利用有限飼料資源生產(chǎn)更多的雞蛋有重要意義。至今國內(nèi)外尚無同類雞種形成規(guī)模化生產(chǎn)的報道。“節(jié)糧小型褐殼蛋雞的選育”項目于1998年通過鑒定，鑒定委員會認(rèn)為，該項成果處于國際領(lǐng)先地位。同年，該項目獲得農(nóng)業(yè)部科技進(jìn)步二等獎。1999年又獲國家科技進(jìn)步二等獎。

　　 七、畜禽遺傳資源保存的理論與技術(shù)(1986～1998)

　　由吳常信教授主持的“畜禽遺傳資源保存的理論與技術(shù)”項目，經(jīng)過13年的努力，已于1999年通過鑒定。該項研究系統(tǒng)地闡明了畜禽遺傳資源保存的理論，分析了影響保種的遺傳因素，提出了保種的優(yōu)化設(shè)計，解決了保種群體的大小、世代間隔的長短、公母畜最佳的性別比例和可允許的近交程度等一系列保種的理論與實際問題，反映出很高的理論水平和學(xué)術(shù)水平，對我國和其他國家的畜禽遺傳資源的保存有重要的指導(dǎo)意義。聯(lián)合國糧農(nóng)組織(FAO)曾邀請他作為主講教師之一，在亞洲動物基因庫培訓(xùn)班上講授他的保種理論與方法。與國內(nèi)外已有的同類研究相比，該項研究無論在廣度與深度方面還是在理論與技術(shù)方面都有獨到之處，特別是保種理論和保種優(yōu)化設(shè)計的提出，反映出高水平的學(xué)術(shù)創(chuàng)見。在研究方法上，把計算機(jī)技術(shù)、分子生物技術(shù)、實驗動物模擬和地理信息系統(tǒng)等技術(shù)綜合應(yīng)用于畜禽遺傳資源保存的理論與實踐，在國際上也是領(lǐng)先的。該項目于1999年獲農(nóng)業(yè)部科技進(jìn)步一等獎，2001年又獲得國家科技進(jìn)步二等獎。

　　吳常信院士在國內(nèi)外有相當(dāng)高的知名度，兼職如下：

　　中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會理事長

　　中國馬業(yè)協(xié)會理事長

　　世界家禽學(xué)會中國分會主席

　　世界“遺傳學(xué)應(yīng)用于畜牧生產(chǎn)大會”國際委員會委員

　　國務(wù)院學(xué)位委員會畜牧學(xué)科評議組召集人

　　教育部科學(xué)技術(shù)委員會副主任

　　 　農(nóng)業(yè)部科學(xué)技術(shù)委員會常務(wù)委員

　　國家自然科學(xué)基金委員會生命科學(xué)部咨詢專家組成員

　　科技部國家獎勵評審專家養(yǎng)殖組組長

　　北京市人民政府顧問

　　《中國科學(xué)》C輯（生命科學(xué)）執(zhí)行副主編

　　《中國畜牧獸醫(yī)學(xué)報》編委會主任

　　《中國畜牧雜志》編委會主任

　　《亞洲—澳大利亞畜牧科學(xué)》編委。

　　　●論著

　　為建立安全_優(yōu)質(zhì)_高效的飼料生產(chǎn)體系而努力

　　畜牧獸醫(yī)的發(fā)展要堅持走科技創(chuàng)新的道路

　　關(guān)于畜禽遺傳資源保存和利用中幾個學(xué)術(shù)問題的討論

　　關(guān)于優(yōu)質(zhì)雞育種與生產(chǎn)中幾個問題的探討

　　有關(guān)我國豬育種幾個問題的探討

　　我國蛋雞育種的策略探討

　　畜禽遺傳育種技術(shù)的回顧與展望

　　新年話家畜

　　積極推進(jìn)分子生物技術(shù)在我國畜禽育種中的應(yīng)用

　　現(xiàn)代豬育種技術(shù)

　　分子生物技術(shù)在中國動物育種中的應(yīng)用

　　畜禽遺傳資源保存的理論與技術(shù)

　　畜禽保種“優(yōu)化”方案分析

　　數(shù)量遺傳學(xué)與動物育種中幾個問題的討論

　　畜禽主要經(jīng)濟(jì)性狀（肉、蛋、奶）的遺傳改進(jìn)與育種新技術(shù)

　　　●著作

　　《中國家禽研究》

　　　●主編

　　《英漢畜牧詞典》（與閻漢平合作）