1982年至1989年，在復旦大學國際政治系獲法學學士、碩士學位，導師是王邦佐教授。

       2002～2005年，在北京師范大學經(jīng)濟與資源管理研究院獲經(jīng)濟學博士學位，導師是李曉西教授，研究方向為宏觀經(jīng)濟管理，論文題目是《政府經(jīng)濟管理能力及評價研究》。

　　2006年任，在中央人民政府駐澳門特別行政區(qū)聯(lián)絡辦公室辦公廳工作，任辦公廳副主任。

　　1989年一2000年，在甘肅省政府研究室工作。曾任財貿(mào)處處長、綜合處處長。

       2000—2006年在國務院研究室工作，任副司長。主要從事宏觀經(jīng)濟研究、政策咨詢工作，多次參與中央經(jīng)濟工作會議文件、《政府工作報告》等文稿起草，參與多項重大課題調(diào)研，發(fā)表論文數(shù)十篇，數(shù)次獲國務院研究室優(yōu)秀調(diào)研成果獎。

      2008年任中央人民政府駐澳門聯(lián)絡辦辦公廳副主任。

       2011年2月17日，中共中央政治局常委、國務院副總理李克強在全國深化醫(yī)藥衛(wèi)生體制改革工作會議講話中強調(diào)指出，農(nóng)村醫(yī)改要健全鄉(xiāng)村基層醫(yī)療衛(wèi)生服務體系，筑牢網(wǎng)底，全面推進基層醫(yī)療衛(wèi)生機構(gòu)綜合改革。 

為貫徹落實李克強重要講話精神，2月21日，國務院研究室科教文衛(wèi)司副司長候萬軍，在中科院廣州分院常務副院長黃寧生、深圳先進技術(shù)研究院副院長呂建成的陪同下，調(diào)研考察了深圳先進院與廣東省博羅縣人民政府合作建設(shè)的“全民低成本健康農(nóng)村三基醫(yī)療網(wǎng)底工程”。

       侯萬軍聽取了合作雙方的匯報，參觀了村醫(yī)對低成本健康檢查床和便攜式體檢包的操作使用情況，考察了醫(yī)療設(shè)備在服務村民中實現(xiàn)健康檔案建檔、疾病診斷與轉(zhuǎn)診、健康教育等方面的應用，了解了村民在工程實施前后健康消費的模式變化和便利性變化。侯萬軍對全民低成本健康農(nóng)村三基醫(yī)療網(wǎng)底工程建設(shè)給予了高度評價。他認為，中科院低成本健康網(wǎng)底工程在當前新醫(yī)改攻堅年顯得尤為可貴，真正體現(xiàn)了中科院科技服務民生、為國家排憂解難的光榮使命。

       侯萬軍指出，中科院為國家醫(yī)療事業(yè)發(fā)展，大力實施低成本健康工程，積極推動國家戰(zhàn)略的建立和實施，項目團隊要努力工作，力爭在短時間內(nèi)完成國內(nèi)第一個“低成本健康示范縣”的工程建設(shè)，為國家醫(yī)改和全民健康事業(yè)的發(fā)展作出更大貢獻。

       侯萬軍要求，博羅縣政府要盡快全面推廣“全民低成本健康農(nóng)村三基醫(yī)療網(wǎng)底工程”，逐步完成全縣全民健康覆蓋和醫(yī)療衛(wèi)生信息化系統(tǒng)的建立，解決居民看病難的問題，為國家醫(yī)改和全民健康事業(yè)的健康發(fā)展探索市場通路，努力在2012年“全民健康日”實現(xiàn)博羅全民健康的“幸福博羅”目標。

      黃寧生認為，中科院在博羅建設(shè)低成本健康網(wǎng)底示范工程是院省合作的一個重點工程，也是一項十分重要的工作，希望合作雙方共同努力，攜手推進，為我國醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)的發(fā)展作出貢獻。

“低成本健康”是中科院針對我國基層衛(wèi)生醫(yī)療現(xiàn)狀和國家戰(zhàn)略需求部署的重大專項，是由深圳先進院等17家單位參與、23個項目構(gòu)成的低成本健康醫(yī)療專項。項目的進展和普及情況受到胡錦濤總書記的關(guān)注，現(xiàn)已在上海、江蘇、廣東、青海、內(nèi)蒙、山東、陜西、湖北等地投入示范運營，覆蓋了400萬村民，滿足了當?shù)卮迕癯Ｒ娂膊≡\治基本要求，有效減少了無效轉(zhuǎn)診。