1981-1988蘭州大學(xué)化學(xué)系有機(jī)化學(xué)專業(yè)學(xué)習(xí)，分獲理學(xué)學(xué)士學(xué)位和理學(xué)碩士學(xué)位。

1988-1993西南師范大學(xué)化學(xué)系從事有機(jī)化學(xué)教學(xué)和科研工作，歷任助教和副教授。

1993-1996中國科學(xué)院化學(xué)研究所學(xué)習(xí)，獲理學(xué)博士學(xué)位。

1996-2000 中國科學(xué)院成都有機(jī)化學(xué)研究所從事不對稱催化反應(yīng)研究，歷任副研究員和研究員，不對稱合成聯(lián)合開放實驗室副主任，于1999被評聘為博士生導(dǎo)師。

1998-1999 美國Colorado State University化學(xué)系做博士后研究。

2000年至今在四川大學(xué)化學(xué)學(xué)院工作，任博士生導(dǎo)師。

2001年入選教育部跨世紀(jì)優(yōu)秀人才培養(yǎng)計劃；

2002年獲國家杰出青年科學(xué)基金資助和四川省有突出貢獻(xiàn)優(yōu)秀專家稱號；

2004年入選四川省學(xué)術(shù)與技術(shù)帶頭人；

2007年入選人事部“新世紀(jì)百千萬人才工程”國家級人選。

2000年-四川大學(xué)化學(xué)學(xué)院教授，博士生導(dǎo)師，四川大學(xué)學(xué)術(shù)委員會委員，四川大學(xué)學(xué)位委員會委員，中國化學(xué)會有機(jī)化學(xué)學(xué)科委員，綠色化學(xué)與技術(shù)教育部重點實驗室副主任。

2013年，當(dāng)選中國科學(xué)院院士。

2017年6月，任致公黨四川省第七屆委員會副主任委員。

中國致公黨第十五屆中央委員會委員。政協(xié)第十三屆全國委員會委員。

任國際刊物Adv. Synth. Catal. Asian J. Org. Chem., Current Org. Synth.顧問編委，任Chin. Chem. Letts.副主編，化學(xué)學(xué)報，有機(jī)化學(xué)、無機(jī)化學(xué)和應(yīng)用化學(xué)編委。

從事不對稱合成方法學(xué)及手性醫(yī)藥、農(nóng)藥和具有生理活性化合物的合成研究。在國家自然科學(xué)基金委重大項目、杰出青年科學(xué)基金和重點項目等國家和部省項目的資助下，馮小明教授針對不對稱合成中發(fā)展新型優(yōu)勢手性催化劑、新反應(yīng)和新策略等核心和挑戰(zhàn)性問題，開展了系統(tǒng)深入的研究。以廉價易得的氨基酸為原料，基于雙功能催化策略，設(shè)計合成了多種新型手性配體和催化劑，實現(xiàn)了一些難以實現(xiàn)的重要不對稱反應(yīng)，為一些重要生理活性手性化合物的合成提供了有效方法。

現(xiàn)已分別在Acc. Chem. Res., Chem. Rev., J. Am. Chem. Soc., Angew. Chem. Int. Ed., Chem. Sci., Chem. Eur. J., Org. Lett.等刊物上發(fā)表論文200多篇，SCI他引超過4300多次。

多篇論文被Nature China、Chemistry World、Synform、Noteworthy Chemistry、Synfacts等雜志正面評述，研究入選“2011年中國高等學(xué)校十大科技進(jìn)展”，中科院2012《科學(xué)發(fā)展報告》和《國家自然科學(xué)基金資助項目優(yōu)秀成果選編》。

1. 手性藥物分子導(dǎo)何的不對稱有機(jī)合成方法研究，教育部博士點基金優(yōu)先領(lǐng)域類(基金批準(zhǔn)號：20110181130014），2012-2014，正在進(jìn)行。

2. 手性氮氧金屬絡(luò)合物催化不對稱多組分反應(yīng)合成多手性中心雜環(huán)化合物，國家自然科學(xué)基金項目(基金批準(zhǔn)號：201172151），2012-2015，正在進(jìn)行。

3.高選擇性的有機(jī)合成新反應(yīng)與新策略，國家自然科學(xué)基金委創(chuàng)新研究群體項目(基金號：21021001),2011-2013, 正在進(jìn)行。

4.手性催化的重要科學(xué)基礎(chǔ), 國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展項目("973") (批準(zhǔn)號: 2010CB833303), 2010-2014, 正在進(jìn)行。

5.不飽和烴高效轉(zhuǎn)化中的前沿科學(xué)問題，國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展項目("973") (批準(zhǔn)號: 2011CB808601), 2010-2014, 正在進(jìn)行。

6.含多功能氫鍵的手性有機(jī)小分子催化劑設(shè)計合成及催化不對稱反應(yīng)研究，國家自然科學(xué)基金項目(基金批準(zhǔn)號：21072133），2011-2013，正在進(jìn)行。

7. 催化雜-Diels-Alder和Reformatsky反應(yīng)合成手性δ-內(nèi)酯，國家自然科學(xué)基金項目(基金批準(zhǔn)號：20902060），2010-2012，正在進(jìn)行。

8. 企業(yè)合作項目。

獲甘肅省科技進(jìn)步三等獎和甘肅省教委科技進(jìn)步二等獎；

獲2009年教育部自然科學(xué)獎一等獎。

2012年國家自然科學(xué)獎二等獎。

獲中國化學(xué)會有機(jī)化學(xué)委員會頒發(fā)的“有機(jī)合成創(chuàng)造獎”。

藥明康德公司頒發(fā)的“生命化學(xué)獎”二等獎。

獲全國優(yōu)秀博士學(xué)位論文指導(dǎo)教師。

全國優(yōu)秀教師和四川省模范教師稱號。

2001年入選教育部“跨世紀(jì)優(yōu)秀人才培養(yǎng)計劃”。

2002年獲國家杰出青年科學(xué)基金資助。

2002年四川省科技進(jìn)步獎壹等獎（第七完成人）。

2002年四川省有突出貢獻(xiàn)優(yōu)秀專家稱號。

2004年入選四川省學(xué)術(shù)與技術(shù)帶頭人和獲國務(wù)院政府特殊津貼。

2007年獲寶鋼優(yōu)秀教師獎。

2007年入選人事部“新世紀(jì)百千萬人才工程”國家級人選。

2009年獲教育部自然科學(xué)一等獎（第一完成人）。

2009年獲全國優(yōu)秀教師和四川省模范教師稱號。

2010年獲第六屆四川省高等教育教學(xué)成果一等獎（第五完成人）。

2010年獲國家自然科學(xué)基金委創(chuàng)新研究群體資助（學(xué)術(shù)帶頭人）。

2010年獲藥明康德公司頒發(fā)的“生命化學(xué)獎”二等獎。

2011年獲中國化學(xué)會有機(jī)化學(xué)委員會頒發(fā)的“有機(jī)合成創(chuàng)造獎”。

2011年獲全國優(yōu)秀博士學(xué)位論文指導(dǎo)教師榮譽(yù)稱號。

基于“新型手性催化劑和高效高選擇性的不對稱催化新反應(yīng)”研究入選“2011年中國高等學(xué)校十大科技進(jìn)展”。

研究工作入選中科院2012《科學(xué)發(fā)展報告》和《國家自然科學(xué)基金資助項目優(yōu)秀成果選編》。

2012年獲國家自然科學(xué)獎二等獎（第一完成人）。

2013年12月，中國科學(xué)院院士。