寶皇女最初與高向王（用明天皇之孫、父不詳）結(jié)婚，生下了漢皇子。630年（舒明天皇2年）1月12日，寶皇女成為舒明天皇的皇后。后來(lái)寶皇女為舒明天皇生下中大兄皇子（天智天皇）、間人皇女（孝德天皇的皇后）、大海人皇子（天武天皇）�！」�元641年（舒明天皇13年）10月9日，舒明天皇去世，其皇后寶皇女當(dāng)時(shí)48歲。舒明天皇去世后，沒(méi)有在皇子之間選定繼承人。舒明天皇駕崩后，日本皇室又陷入長(zhǎng)時(shí)間的爭(zhēng)位危機(jī)。

642年（皇極天皇元年）1月15日，各方終于達(dá)成妥協(xié)，寶皇女即位成為天皇。1月29日，阿曇比羅夫與百濟(jì)的吊使一起回到日本。7月25日，蘇我蝦夷雖然誦讀大乘佛經(jīng)祈雨，但只有少量的降雨，沒(méi)什么效果，于29日放棄。8月1日，皇極天皇向天祈雨后，雷聲大作，大雨傾盆，連下五日。9月3日，皇極天皇命令建造百濟(jì)大寺、船舶。 9月19日，皇極天皇命令營(yíng)造宮室。12月21日，皇極天皇移居小墾田宮。

643年（皇極天皇2年）11月1日，蘇我入鹿進(jìn)攻山背大兄王，數(shù)日后山背大兄王自殺。

645年（皇極天皇5年），三韓（新羅、百濟(jì)、高句麗）進(jìn)貢的使者來(lái)到日本，中大兄皇子與蘇我石川麻呂等人制定了刺殺蘇我入鹿的計(jì)劃。在舉行三國(guó)的進(jìn)貢儀式之時(shí)，皇極天皇出席大極殿，古人大兄皇子隨侍身旁，蘇我入鹿也入殿。之后，中大兄皇子命令衛(wèi)門府緊閉宮門。由蘇我石川麻呂宣讀上表文，中大兄皇子及一干刺客隱藏在暗處，嗣機(jī)刺殺蘇我入鹿。

原本負(fù)責(zé)斬殺蘇我入鹿任務(wù)的眾刺客畏懼蘇我入鹿之威，遲遲不敢動(dòng)手。蘇我石川麻呂宣讀表文快讀到最末尾了，仍遲遲不見(jiàn)佐伯子麻呂等人動(dòng)手，于是驚得直冒冷汗，聲音亂擅，手在抖動(dòng)。覺(jué)查到蘇我石川麻呂可疑狀況的蘇我入鹿問(wèn)：“為什么發(fā)抖？”蘇我石川麻呂回答：“因?yàn)榭拷�天皇，畏懼天皇之威而流了冷汗。�?中大兄皇子見(jiàn)情勢(shì)危急，便親自跳出去，眾刺客也飛快殺出，合力刺殺了蘇我入鹿。蘇我入鹿被殺的次日，蘇我蝦夷在自家的城寨放火，自焚而死。又次日，皇極天皇讓位于同母弟輕皇子（孝德天皇），孝德天皇則向皇極天皇奉上皇祖母尊的稱號(hào)。中大兄皇子被立為皇太子。中大兄皇子任命阿倍內(nèi)麻呂為左大臣，蘇我石川麻呂為右大臣，中臣鐮足為內(nèi)臣（“內(nèi)臣”是日本飛鳥(niǎo)時(shí)代的官職，是內(nèi)大臣的前身），并進(jìn)行了被后世稱之為“大化改新”的政治改革。

651年（白雉2年）3月15日，皇極上皇設(shè)齋供奉十師。

653年（白雉4年），皇極上皇與中大兄皇子一起，離開(kāi)孝德天皇，移居飛鳥(niǎo)河邊行宮。

654年（白雉5年）10月1日，皇極上皇與中大兄皇子一起，去難波長(zhǎng)柄豐碕宮探望患病的孝德天皇。10月10日，孝德天皇去世。

孝德天皇去世后，655年（齊明天皇元年）1月3日，61歲的皇極上皇于飛鳥(niǎo)板蓋宮再度登上皇位（日本史上最早的重祚），成為第37代天皇———齊明天皇。在齊明朝，政治的實(shí)權(quán)由皇太子中大兄皇子掌握。

655年（齊明天皇元年）8月1日，河邊麻呂從大唐回到日本。10月13日，齊明天皇中止?fàn)I建位于小墾田的宮殿。冬季，飛鳥(niǎo)板蓋宮發(fā)生火災(zāi)，齊明天皇移居飛鳥(niǎo)川原宮。在這一年里，高句麗、百濟(jì)、新羅遣使訪問(wèn)日本，其中百濟(jì)使團(tuán)的大使為余宜受、副使為調(diào)信仁、總員達(dá)100余人。蝦夷和隼人率眾內(nèi)附，向日本朝廷進(jìn)貢。

656年（齊明天皇2年）8月8日，高句麗大使達(dá)沙、副使伊利之、總計(jì)81人訪問(wèn)日本。9月，齊明天皇向高句麗派遣大使膳葉積、副使坂合部磐鍬等人。在這一年里，位于飛鳥(niǎo)岡本的宮殿建成，齊明天皇移居新宮，并將其命名為飛鳥(niǎo)岡本宮。岡本宮發(fā)生火災(zāi)。齊明天皇屢屢大興土木，勞役百姓，如建造大倉(cāng)庫(kù)，挖掘大運(yùn)河，營(yíng)建吉野宮等。

657年（齊明天皇3年）7月3日，齊明天皇召見(jiàn)漂浮到筑紫的睹貨邏國(guó)的男2人、女4人。7月15日，齊明天皇命人在飛鳥(niǎo)寺以西，鑄造須彌山之像，舉行盂蘭盆會(huì)，黃昏時(shí)，以睹貨邏人獻(xiàn)祭。

658年（齊明天皇4年）1月13日，左大臣巨勢(shì)德太去世。4月，齊明天皇命令阿倍比羅夫遠(yuǎn)征蝦夷，以降伏的蝦夷恩荷為渟代、津輕二郡的郡領(lǐng)，將有馬浜渡島的蝦夷獻(xiàn)祭。5月，皇孫建王8歲夭折，齊明天皇非常哀慟。7月，僧智通和智達(dá)奉詔乘新羅船前往大唐，師從法相宗玄奘法師，學(xué)習(xí)無(wú)性眾生義。10月15日，齊明天皇行幸紀(jì)溫湯（溫泉名）。11月5日，蘇我赤兄通報(bào)有間皇子謀反之事。11月11日，齊明天皇定有間皇子為絞首刑，其黨徒鹽屋鯯肴和新田部米麻呂為斬刑。

659年（齊明天皇5年）1月3日，齊明天皇從紀(jì)溫湯回宮。3月1日，齊明天皇行幸吉野。3月3日，齊明天皇行幸近江的平浦。3月17日，齊明天皇命人在甘梼丘之東的河邊建造須彌山。3月，阿倍比羅夫征討蝦夷國(guó)，與粛慎作戰(zhàn)歸來(lái)，獻(xiàn)俘49人。7月3日，齊明天皇派遣坂合部石布和津守吉祥前往大唐。7月15日，齊明天皇召集群臣，在京城內(nèi)的寺廟里解說(shuō)盂蘭盆經(jīng)，報(bào)七世父母恩。

660年（齊明天皇6年）1月1日，高句麗使者賀取文等百余人到達(dá)筑紫。3月，齊明天皇命令阿倍比羅夫討伐粛慎。阿倍比羅夫在大河畔被粛慎攻擊，求助于渡島的蝦夷。阿倍比羅夫追擊粛慎至幣賄弁島，交戰(zhàn)后破之。5月8日，高句麗使者賀取文等人到達(dá)難波館。5月，齊明天皇命人制作百個(gè)高座和百件納袈裟，舉行仁王般若會(huì)。阿倍比羅夫進(jìn)獻(xiàn)粛慎俘虜50余人。齊明天皇命人在石上池之畔修建須彌山。7月16日，高句麗使者賀取文等人歸國(guó)。7月，百濟(jì)被大唐和新羅的聯(lián)軍攻滅。9月5日，百濟(jì)建率的某和沙彌覺(jué)從等來(lái)到日本，轉(zhuǎn)達(dá)鬼室福信為百濟(jì)復(fù)興而繼續(xù)戰(zhàn)斗的信息。10月，鬼室福信派遣貴智等人向日本朝廷獻(xiàn)上唐軍俘虜百余人，請(qǐng)求援軍及讓皇子扶余豐璋回到百濟(jì)。齊明天皇為幫助百濟(jì)，命令出兵，并以禮相送豐璋歸國(guó)。12月24日，齊明天皇為了準(zhǔn)備軍械，移駕難波宮，命令制造武器和船舶。

661年（齊明天皇7年）1月8日，齊明天皇到達(dá)大伯海。1月14日，齊明天皇移駕伊予熟田津的石湯行宮。3月25日，齊明天皇到達(dá)娜大津，移駕磐瀨行宮。5月9日，齊明天皇移駕朝倉(cāng)橘?gòu)V庭宮，進(jìn)行備戰(zhàn)，欲統(tǒng)兵渡海西征朝鮮半島，但因旅途勞頓一病不起。5月23日，耽羅第一次派遣王子阿波伎等人向日本朝貢。7月24日，遠(yuǎn)征軍出發(fā)之前，齊明天皇在朝倉(cāng)橘?gòu)V庭宮去世。8月1日，皇太子中大兄皇子為了照管齊明天皇遺體，到達(dá)磐瀨宮。10月，齊明天皇遺體經(jīng)海路出航回到京城飛鳥(niǎo)。11月7日，齊明天皇遺體于飛鳥(niǎo)之川原下殯。

曾祖：敏達(dá)天皇

祖父：押坂彥人大兄皇子

父親：茅渟王

母親：吉備姬王（欽明天皇之孫女）

從叔伯兼第一任丈夫：高向王

從叔伯兼第二任丈夫：舒明天皇

子女：漢皇子、天智天皇、間人皇女、天武天皇

弟弟：孝德天皇