2016年4月18日，被國家體育總局授予運動健將稱號。

2017年2月21日，2017年全國春季游泳錦標賽在陜西省渭南市渭南體育中心游泳館落幕。男子1500米自由泳比賽中，浙江隊何峻毅和天津隊張博昭分列二、三位。

2018年1月19日，何峻毅獲得2018年全國春季游泳錦標賽南區(qū)男子200米自由泳冠軍。

2018年1月21日，何峻毅以49秒90獲得2018年全國春季游泳錦標賽南區(qū)男子100自冠軍。

2018年4月15日，何峻毅以22秒60獲得2018年全國游泳冠軍賽暨亞運會選拔賽男子50米自由泳季軍。

2018年8月6日，入選雅加達亞運會中國代表團運動員名單。

2018年10月16日，何峻毅以49秒41獲得2018年全國游泳錦標賽男子100米自由泳亞軍，何峻毅幫助浙江隊以3分54秒54獲得男女4乘100混接力季軍。

2018年10月17日，何峻毅以22秒73獲得2018年全國游泳錦標賽男子50米自由泳亞軍，何峻毅幫助浙江隊以3分39秒50獲得男子4乘100米混合泳接力冠軍。

2018年12月11日，何峻毅幫助中國隊以3分10秒55獲得2018年國際泳聯(lián)世界短池游泳錦標賽男子4X100米自由泳接力第七名，并打破全國紀錄。

2019年1月7日，何峻毅以22秒90獲得2019年全國春季游泳錦標賽男子50米自由泳并列冠軍。

2019年1月8日，何峻毅以48秒84獲得2019年全國春季游泳錦標賽男子100米自由泳冠軍。

2019年3月24日，何峻毅跟隨浙江隊以3分18秒17獲2019年全國游泳冠軍賽暨世錦賽選拔賽男子4X100米自由泳接力冠軍。

2019年3月28日，以48秒10獲2019年全國游泳冠軍賽暨世錦賽選拔賽男子100米自由泳冠軍。

2019年3月29日，何峻毅跟隨浙江隊獲得2019年全國游泳冠軍賽暨世錦賽選拔賽男子4X200米自由泳接力亞軍。

2019年3月30日，何峻毅以22秒62獲得2019年全國游泳冠軍賽暨世錦賽選拔賽男子50米自由泳第四名。

2019年3月31日，何峻毅跟隨浙江隊獲得2019年全國游泳冠軍賽暨世錦賽選拔賽男子4X100米混合泳接力冠軍。

2019年4月27日，何峻毅跟隨接力三隊以3分28秒84獲2019年國際泳聯(lián)冠軍游泳系列賽廣州站男女混合4乘100自接力第一。

2019年7月，入選光州游泳世錦賽中國隊名單。

2019年8月9日，獲2019年國際泳聯(lián)游泳世界杯中國濟南站男子50米自由泳第4。跟隨中國隊獲男女混合4X100米自由泳接力第二。

2019年9月6日，跟隨浙江隊獲2019年全國游泳錦標賽男子4乘100米自由泳第一。

2019年9月9日，獲2019年全國游泳錦標賽男子100米自由泳第一。

2019年10月19日，跟隨中國隊獲2019年第七屆世界軍人運動會男子4乘200米自由泳接力第一，另獲男子50米自由泳第三。

2019年10月20日，跟隨中國隊獲2019年第七屆世界軍人運動會男子4乘100米自由泳第二。

2019年10月21日，跟隨中國隊獲2019年第七屆世界軍人運動會男女混合4乘100米自由泳冠軍。

2019年10月22日，跟隨中國隊獲2019年世界軍人運動會男子4乘100米混合泳接力亞軍，另獲男子100米自由泳第4。

2020年3月，獲代表中國國家隊參加2020年東京奧運會游泳項目男子50米自由泳B標、男子100米自由泳比賽資格。