商科元是浙江嵊州石璜鎮(zhèn)人，1995年出生，9歲時(shí)被輸送到紹興市體校訓(xùn)練，4年后送入省隊(duì)，當(dāng)時(shí)他的100米自由泳成績(jī)已經(jīng)在1分鐘以內(nèi)。被送入省隊(duì)后，商科元得到了著名教練同時(shí)也是孫楊的教練朱志根的指導(dǎo)，經(jīng)過3年的訓(xùn)練，成績(jī)突飛猛進(jìn)。

2016年鉅派杯全國(guó)游泳冠軍賽暨里約奧運(yùn)選拔賽男子200米自由泳決賽，商科元以1分47秒94獲得亞軍。男子4*200米自由泳接力，由汪順、商科元、李昀琦和邱子傲出戰(zhàn)的國(guó)家隊(duì)，以7分13秒19的成績(jī)奪冠。

2016年7月18日，2016年里約熱內(nèi)盧奧運(yùn)會(huì)中國(guó)奧運(yùn)代表團(tuán)成立，商科元名列出征游泳隊(duì)運(yùn)動(dòng)員名單。

2016年亞洲游泳錦標(biāo)賽，11月18日晚，男子4乘200自，由汪順、商科元、邱子傲和錢智勇組成的中國(guó)隊(duì)，以7分14秒67獲得亞軍。

2018年4月15日，商科元以3分53秒07獲得2018年全國(guó)游泳冠軍賽暨亞運(yùn)會(huì)選拔賽男子400米自由泳季軍。

2018年8月6日，入選雅加達(dá)亞運(yùn)會(huì)中國(guó)代表團(tuán)運(yùn)動(dòng)員名單。

2018年8月20日，幫助中國(guó)隊(duì)以7分05秒45獲得2018年雅加達(dá)亞運(yùn)會(huì)男子4X200米自由泳接力亞軍。

2018年10月14日，商科元以1分49秒70獲得2018年全國(guó)秋季游泳錦標(biāo)賽男子200米自由泳亞軍。

2018年12月5日，中國(guó)游泳隊(duì)正式公布2018年國(guó)際泳聯(lián)世界游泳錦標(biāo)賽（25米）42人參賽名單，商科元入選。

2019年3月29日，商科元跟隨浙江隊(duì)獲得2019年全國(guó)游泳冠軍賽暨世錦賽選拔賽男子4乘200米自由泳接力亞軍。

2019年7月，入選光州游泳世錦賽中國(guó)隊(duì)名單。

2019年8月9日，獲2019年國(guó)際泳聯(lián)游泳世界杯中國(guó)濟(jì)南站男子50米自由泳第8。

2019年8月10日，獲2019年國(guó)際泳聯(lián)游泳世界杯中國(guó)濟(jì)南站男子200米自由泳第4。

2016年4月24日，全國(guó)游泳冠軍賽暨里約奧運(yùn)選拔賽在北京天壇公寓舉行表彰大會(huì)，商科元獲團(tuán)隊(duì)精神獎(jiǎng)。