在美國期間，馬超俊適逢孫中山到舊金山宣傳革命，得致公堂黃三德介紹，他認識了孫中山并加入同盟會，獻身革命。1905年，馬超俊離美往日本，就讀于明治大學，后來奉孫中山之命回國策動革命，入漢陽兵工廠，隨后又轉入上海制造局當技工，宣傳革命真理，組織工人參加革命。粵、漢等各地勞工深受其影響，紛紛組織工會，響應革命，貢獻良多。1907年12月，馬超俊參加鎮(zhèn)南關之役，失敗后，開辦了“中興公司”，掩護革命黨人，聯(lián)絡集會秘密活動。1911年10月武昌起義，他率領海員100余人，組織廣東華僑敢死隊，由滬赴漢，轉戰(zhàn)漢口大智門，繼而堅守漢陽兵工廠，與清軍馮國璋部苦戰(zhàn)8日8夜，彈盡援絕，才率殘部撤回武昌。

1911年10月10日，湖北新軍中的革命黨人發(fā)動了武昌起義，攻占總督署，湖廣總督瑞和新軍第八鎮(zhèn)統(tǒng)制張彪狼狽逃竄。廣東籍華僑敢死隊近百人，由馬超俊任隊長，奔赴武漢，在黃興的指揮下，守衛(wèi)漢陽兵工廠，反擊清兵，表現(xiàn)出“革命熱誠”和“犧牲勇氣”。直到11月20日，北洋軍馮國璋部猛攻漢陽，廣東籍華僑敢死隊才奉命撤離。

1927年，國民政府遷都南京，鑒于勞工立法的重要性，成立了勞工法起草委員會，后并入是年9月成立的勞工局，由馬超俊先生擔任局長，兼勞工法起草委員會主任委員，負責勞工法的立法事宜。

1928年2月，馬超俊調廣東農(nóng)工廳，在該廳成立了勞動法起草委員會，歷經(jīng)十一個月的時間起草完成《勞動法典草案》，包括勞動契約法、勞動協(xié)約法、勞動組織法、勞動訴訟法、勞動救濟法、勞動保險法共七篇、二十一章、八百六十三條。此一法典草案完成后，即轉送中央交新成立之立法院審議，遭立法院決議將該草案留備參考，而未能見諸實施。然此后立法院所研擬之勞工立法，其內容大多取材于此，可謂中國最早的完整勞工法案版本。

1931年春，中國國民黨中央執(zhí)行委員會第126次常務會議決議“暨南大學成立新的校董會”，馬超俊為常務校董成員之一。

1937年12月12日，日寇的膏藥旗插在了南京西南城墻的一角。南面各門被攻破是在12日清晨。此前，南京市長馬超俊在12月1日命令全體市民，帶著寢具和餐具移居到設立在市中心官廳街的“南京國際安全區(qū)”。這個南京安全區(qū)是由15名第三國人（7名美國人、4名英國人、3名德國人、1名丹麥人）管理的避難地。這里面還有金陵大學，美國的大醫(yī)院和高等法院。由于日本的領事館以及其它政府建筑物林立于此，所以馬市長命令市民移入該區(qū)。

1946年1月15日夜，何應欽將軍在黃埔路陸軍總部召開了有當時南京市長馬超俊、陸軍總部工兵指揮官馬祟六、南京憲兵司令部張鎮(zhèn)等人參加的一次會議。把賣國賊汪精衛(wèi)的墓焚掉，保持南京中山陵的神圣和莊嚴。

1949年去臺，受聘臺灣當局領導人辦公室“國策顧問”，并任國民黨中央評議委員。

1956年，由馬超俊、陸京士發(fā)起一次洪門懇親大會。結果國民黨不允許青洪幫公開開山堂收徒弟。青洪幫只有秘密地進行，成為臺灣的黑社會組織。1960年，出任國民黨中央紀律委員會主任委員。1969年退職轉任臺灣當局領導人辦公室“資政”。曾任《中國勞工運動史》編纂委員會主任委員。

1969年8月4日患腦血管栓塞癥，長期臥病醫(yī)院，于1977年9月19日在臺灣榮民總醫(yī)院病逝，享年92歲，葬于臺北近郊金山富貴墓園。

其著有《中國勞工運動史》、《比較勞動政策》、《三民主義勞工政策》等。

民國初建，馬超俊任國會議員，黎元洪委任其漢冶礦務督辦以籠絡，馬超俊知其意而堅辭不就。之后，袁世凱稱帝陰謀敗露，他乃復回漢口，參加“鐵血團”組織，被捕入獄8個月，孫中山托伍廷芳、溫宗堯從中活動，馬超俊終于獲釋。

1914年，馬超俊受命到廣州設立海鷗針織廠，秘密進行倒袁運動，同時組織“暗殺隊”�！岸�次革命”失敗后，馬超俊避到日本，孫中山遣送其入琴瑟湖八日市中華革命黨航空學校學習飛行，歷時2年。

1916年，馬超俊隨中華革命軍東北總司令居正領導之航空回國參加討袁之役，是年4月率機隊轟炸濟南山東訪府署，6月6日袁世凱在全國人民的憤怒聲討中死去，反袁運動結束，馬超俊轉赴北平籌設民間航空學校，為創(chuàng)辦航空學校募集資金。

1917年6月，孫中山電召馬超俊南下，參加“護法運動”，從此離開航空界。

1917年，馬超俊受命擬訂“開展全國勞工運動計劃”，是年底“全國機器工人聯(lián)合會”于廣州成立。

1920年，孫科任廣州市市長，馬超俊擔任廣州市府特別助理，繼任廣州市政府委員。

1927年歸國后，任國民政府勞工局長兼“勞工立法起草委員會”主任委員。

1928年任國民黨廣東省黨部整理委員、廣州特別市黨部執(zhí)行委員長兼宣傳部長、廣東省政府委員、農(nóng)工廠廳長、建設廳長等職。

1929年任廣州市黨部執(zhí)行委員，國民黨第三屆中央候補執(zhí)委，同年出席日內瓦國際勞工大會，擔任勞方代表。

1931年5月1日，馬超俊膺任歐美各國勞工考察專員，11月任南京市市長。

1935年任國府委員，1937年復任南京市市長。

1938年任中國戰(zhàn)時兒童救濟會副會長、全國慰勞總會副會長、國民黨中央社會部副部長。

1940年任國民黨組織部副部長。

1945年抗戰(zhàn)勝利，馬超俊第三次出任南京市市長。

1946年12月調任中央農(nóng)工部長，領導各省、市總工會，及全國性鐵、工、郵、鹽、礦各業(yè)復恢組建工會，綜合成立全國總工會，同年當選國民黨中央執(zhí)行委員會常務委員，國民黨代表大會代表。

馬超俊曾參與策動勞工運動。

在中國勞工運動史中，他參與策動的有：

1919年廣州機器工人罷工，1920年香港機器工人大罷工和1922年香港海員大罷工，均取得重大的勝利。陳炯明叛變后，馬超俊組織發(fā)動工人罷工，陳炯明下令懸賞10萬元逮捕馬超俊，馬超俊遂離粵奉命組織游擊隊討陳，1923年1月率部參加光復廣州之役，4月任廣東石井兵工廠副廠長，后因護廠有功升為廠長。在任期內，曾秘運槍械500支給黃埔軍校武裝學生軍。

1926年，馬超俊奉派南北美洲考察工人運動，并聯(lián)絡海外華僑吸收參加革命工作，1927年歸國。