陳錦年教授多年來主要從事“大尺度海氣相互作用”、“極地科學(xué)研究”和“海氣界面通量輸送”等研究，其研究方向和研究內(nèi)容不僅是中科院海洋所的創(chuàng)新研究方向，也是全球氣候變化機(jī)理研究的重要研究內(nèi)容，是全球性的熱門研究課題。這一研究方向主要涉及海洋變化及其氣候效應(yīng)的機(jī)理研究，它的研究目的主要是為工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)、漁業(yè)、海洋生態(tài)環(huán)境、軍事等提供服務(wù)，為人類賴以生存的環(huán)境變化提供科學(xué)依據(jù)，為世界各國政府部門控制污染排放、保護(hù)生存環(huán)境的決策提供科學(xué)性的指導(dǎo)。

承擔(dān)國家自然科學(xué)基金，國家科技部“863”項(xiàng)目以及中國科學(xué)院創(chuàng)新項(xiàng)目10余項(xiàng)。發(fā)表研究報(bào)告和論文60余篇（其中SCI（EI）10篇）。曾獲得中國氣象涂長望科技獎。