馬虎臣晚年多以潑墨寫意清幽的雨景，作雨幕，顯溫情；大筆著落雪山，露清寒蒼茫之意，用筆兼工帶寫，人物造型傳神，尤善寫意墨牡丹，一花數(shù)葉，疏斜歷亂，別具情趣。光緒壬午 （1882）作《梧桐秋風(fēng)圖》中堂，雙桐并峙，拔地頂天，枝條搖曳，一葉飄零，根部怪石嶙峋，秋菊吐蕊，并以如隸似篆的行書題跋:“一葉飄處天下知秋，傲霜之枝撐樹底而獨(dú)留。問昔之千紅萬紫果誰堪此颼，有識(shí)者當(dāng)弗輕斥為隱逸之流�！惫P墨簡略，筆意縱您，蕭疏中見蓬勃生機(jī)。山水則上追董北苑、梅花道人，取云鎖霧遮峰巒出沒的高遠(yuǎn)意境。 馬虎臣的作品深受時(shí)人喜愛，還遠(yuǎn)布陜西一帶。光緒庚子慈槽太后逃至西安，見居所懸掛 馬虎臣所繪墨牡丹，頗有好評(píng)。當(dāng)詢其履歷，知為回族時(shí)，臉色立沉，即命撤換。原因是對(duì)同治年間陜、甘回民反清斗爭耿耿于懷。他常與回族進(jìn)士馬中律、舉人馬世煮以及名畫家 朱克敏、溫虛舟友好往來。清同治六年，陜甘總督穆圖善慕名觀其畫卷，也感慨萬端，嘆賞不絕。暮年時(shí)賞得四川名畫家甘醉霞為其繪小月像,湘籍書法家謝威鳳于畫像卷幅題贊跋，以結(jié)書畫之契交。見《金城書畫名人簡錄》、《中國美術(shù)家人名辭典》《甘肅古今書畫名人考錄辭典》。

馬虎臣對(duì)伊斯蘭教頗有研究，著有《至圣贊》，全篇文采飛揚(yáng)，感情真摯，高度贊揚(yáng)了伊斯蘭教最后的圣人穆罕默德。