1987年，麻省理工學院物理系本科畢業(yè)

1993年，麻省理工學院物理學博士

1993年－1996年，加州理工學院博士后研究員

1996年－2001年，賓夕法尼亞大學天文物理系助理教授

2001年－今，加州柏克萊大學天文物理系教授

馬中佩是知名新聞學者馬驥伸和資深新聞人黃肇珩的女兒。私立復興小學、復興中學初中部畢業(yè)、高中就讀臺北市立第一女中，升高中三年級時即跳級就讀麻省理工學院，并一路取得物理學博士學位。她在麻省理工學院的指導教授是徐遐生院士。

她之后歷任加州理工學院博士后研究、賓州大學天文及物理學系助理教授、柏克萊加州大學天文研究員�，F(xiàn)任柏克萊加州大學天文物理學教授，及兼任中研院天文所副研究員。研究的主題是天文物理和宇宙學。因發(fā)現(xiàn)超級大黑洞震驚世界。

馬中佩雅擅音樂，就讀北一女中時，曾經(jīng)獲得全臺灣小提琴競賽冠軍。在麻省理工學院物理系攻讀時，曾在波士頓新英格蘭音樂學院同時修讀小提琴表演課程，并登臺演出。

馬中佩已婚，并育有子女。