早年即追隨劍南西川節(jié)度使陳敬瑄，官至為營使。黃巢起義軍攻陷京師后，唐僖宗出居成都，陳敬瑄遣黃頭軍部將李鋋、鞏咸率軍一萬五千人守衛(wèi)興平，數(shù)敗黃巢軍。起義軍稱蜀兵為“鵶兒”，每次戰(zhàn)斗，都互相告誡說“毋與鵶兒斗�！标惥船u喜其兵可用，增選士卒二千人，由高仁厚率領(lǐng)。

　　此前，長安有些流氓，剽掠鄉(xiāng)里，人稱“閑子”。黃巢入據(jù)長安后，很多人避難到寶雞，閑子趁機大事?lián)屄�，官吏無法不能制止。高仁厚知道后，派兵殺數(shù)千人，自是閭里乃安。

　　這時，邛州賊首阡能眾數(shù)萬攻略蜀中諸縣，列營數(shù)十，陳敬瑄召加高仁厚，命他討伐。阡能遣諜者入軍中，吏執(zhí)以獻(xiàn)，諜自言父母妻子囚于賊，約不得軍虛實且死。仁厚哀之，曰：“為我報賊，明日我且戰(zhàn)，有能釋甲迎我者，署背曰u2018歸順u2019，皆得復(fù)農(nóng)矣�！笨v諜去，命諸將毀柵，鼓而前。賊渠羅渾擎設(shè)伏詐降，仁厚遣將不持兵入諭其眾，皆真降。渾擎詐窮而逸，吏執(zhí)之，仁厚曰：“愚人不足語�！苯当娛鸨车妹猓瑒t告諸壁：“大軍至�！辟\帥句胡僧大驚，斬之，莫能禁，眾執(zhí)胡僧以降。韓求知大賊已禽，徇諸壁曰：“敢出者斬！”眾罵之，求赴水死，眾鉤出，斬以徇，余柵皆下。仁厚按轡徘徊視賊壘，吏請焚之，仁厚命取財糧，乃縱火，尸賊成都。仁厚還，天子御樓勞軍，授仁厚檢校尚書左仆射、眉州刺史。

　　敬瑄與仁厚謀曰：“秀升未禽，貢輸梗奪，百官乏奉，民不鹽食。公能破賊，當(dāng)以東川待公。”仁厚許之。詔拜行軍司馬。仁厚聞賊儲械、子女皆在屯，乃以銳兵瀕江，伐木頹水礙舟道，負(fù)岸而陣。使游軍逼賊，久不戰(zhàn)，則夜以千卒持短刀、強弩直薄營，火而噪之。秀升率舟兵救火，仁厚遣人鶩沒鑿舟，皆沈，眾懼，多潰。秀升斬潰兵，欲脅止之，眾怒，執(zhí)秀升以降。仁厚問狀，對曰：“天子蒙塵，反者何獨我？”仁厚檻車送行在，斬于市。

　　東川節(jié)度使楊師立初隸神策軍，累遷檢校司空、同中書門下平章事。聞敬瑄仁厚代己，有望言。敬瑄諷帝召師立以本官兼尚書右仆射，師立益怒，移檄言敬瑄十罪，殺監(jiān)軍田繪，屯涪城，遣兵攻綿州，不克。又檄劍州刺史姚卓文共攻成都，假卓文為指揮應(yīng)接使，卓文不應(yīng)。帝乃下詔削官爵。敬瑄即表仁厚為東川節(jié)度留后，楊茂言為行軍副使，楊棠為諸軍都虞侯，率兵三萬討之。師立遣大將張士安、鄭君雄守鹿頭關(guān)。仁厚次漢州，前軍戰(zhàn)德陽，師立嬰城，閱四旬，夜出兵擾北柵，仁厚設(shè)兩翼而伏，披柵門列炬，賊不敢進(jìn)，伏發(fā)，擊走之。楊茂言謂仁厚且敗，引兵走，久乃還。明日，會諸將，仁厚曰：“副使當(dāng)以死報天子�！睌囟�徇。于是士安不敢出，師立自督士，十戰(zhàn)皆北。仁厚約城中斬首惡者賞，君雄呼于軍曰：“天子所討，反者耳，吾等何與？”乃與士安嘩而進(jìn)，以仁厚書示師立曰：“請以死謝眾。”自沈于池死。君雄悉誅其家，獻(xiàn)首天子。仁厚入府，縱系囚，賑貧絕。詔拜劍南東川節(jié)度使。

　　光啟二年，遂據(jù)梓州，絕敬瑄。君雄時為遂州刺史，亦陷漢州，攻成都。敬瑄使部將李順之逆戰(zhàn)，君雄死。又發(fā)維、茂州羌軍擊仁厚，斬之。乾寧中，皆追贈司徒。