紛紛亂世
三位教皇同時在位、互相攻擊的時候以 本尼狄克九世最壞、最無恥，他竟然將教 皇職位出售。為了結(jié)束這種混亂局面并維護(hù)健全的教皇制，克呂尼運動的改革家們決定向神圣羅馬帝國皇帝德國的 亨利三世求援。
亨利三世是一位虔誠的信徒，非常贊賞克呂尼運動。于是在他的領(lǐng)導(dǎo)下，開了一次宗教會議，把西維斯特三世革職，同時 格列高利六世辭職，并將他放逐到德國。他又召開另一次會議，將本尼狄克九世革職。教皇座位本來就不能容三人同坐。自此，三位競爭者相繼被摔下了寶座。
為了避免再卷入羅馬的腐敗，亨利三世另選一位德國主教就任教皇職，就是教皇克雷芒二世。然而這個教皇與繼任的教皇 達(dá)馬蘇斯二世都很短命，在位不久就去世。亨利便指派自己的表兄弟、土爾主教為教皇，是為利奧九世。也是教皇史上第4位，也是和他的兩個前任一樣的德國人。利奧九世在位五年(公元1049一1054年)，是克呂尼運動的強力支持者，正因為他有改革的熱誠，才被皇帝指派為教皇。
教會改革
他一登位就非常忙碌，首先是改組 樞機(jī)主教會議(College of Cardinals)。原來在羅馬早已存在所謂紅衣主教，這些紅衣主教是教皇個人的助理及顧問。從形態(tài)上看，紅衣主教會議和教皇的關(guān)系正如內(nèi)閣和總統(tǒng)之間的關(guān)系一樣。
利奧九世即位之初，就發(fā)現(xiàn)這個紅衣主教會議全部成員都是羅馬人，他們來自羅馬的貴族，長期控制教皇，腐化了教皇制，而且不理會克呂尼革新運動。教皇利奧九世重新任命接受 克呂尼運動的人為 紅衣主教，并從不同地區(qū)挑選新的紅衣主教。這樣，圍繞著他的一群顧問，不但是他可以信任的人，而且是來自歐洲不同地區(qū)的人。?這樣新教皇不遺余力地推動革新，他走遍德國、法國，在各地召開宗教會議，也在各地加強教皇的權(quán)勢。他所做的一切事，深得克呂尼修道院院長筍哥(Hugo)的合作。他強調(diào)三件事：(一)神甫絕對禁止結(jié)婚。(二)不得實行圣職買賣。(三)非經(jīng)圣職人員及會眾選舉，沒有人可擔(dān)任教會職務(wù)。
東西分裂
然而教皇利奧九世在位時也有難處。我們還記得東西方教會之間早有歧異，距離日遠(yuǎn)，只是到目前為止，教會仍是一體。直到利奧九世在位，東西方教會才正式?jīng)Q裂。這事導(dǎo)因于利奧九世與君士坦丁堡主教長瑟如拉留(Michael Cerularius)之間的不睦。公元1054年，教皇利奧九世的代表拿著教皇革除瑟如拉留教籍的詔諭，放在君士坦丁堡圣蘇菲亞教堂的圣壇上。主教長瑟如拉留盛怒之下，一報還一報，也革除了教皇利奧九世的教籍。于是東西方教會正式分裂為二：東方為希臘教會，西方為拉丁教會。教皇利奧九世去世后，德皇亨利三世又指派一位德國人為教皇，號稱維克托二世。
