1960年3月，呂建出生于江蘇省南京市，1982年畢業(yè)于南京大學(xué)計(jì)算機(jī)系。

1982年，畢業(yè)于南京大學(xué)計(jì)算機(jī)系，1988年獲博士學(xué)位。?

1994年，進(jìn)入“國(guó)家教委跨世紀(jì)優(yōu) 秀人才計(jì)劃”。

1993年－1994年，在英國(guó)曼徹斯特大學(xué)計(jì)算機(jī)系作為訪問(wèn)學(xué)者。

1995年，獲“國(guó)家杰出青年科學(xué)基金”資助。

1997年，進(jìn)入國(guó)家“百千萬(wàn)人才工程”（第一、二層次）。

1997年，進(jìn)入江蘇省“333”人才培養(yǎng)工程第二層次，并于2002年轉(zhuǎn)入第一層次。

2000年，被南京大學(xué)聘為特聘教授。

1995年，在聯(lián)合國(guó)大學(xué)澳門國(guó)際軟件研究所從事研究工作。

2010年5月——2016年5月，任南京大學(xué)副校長(zhǎng)。

2016年5月——2018年1月，任南京大學(xué)常務(wù)副校長(zhǎng)。

2018年1月—— 2018年3月，任南京大學(xué)校長(zhǎng)（副部長(zhǎng)級(jí)）。

2018年3月——，任第十三屆全國(guó)人民代表大會(huì)常務(wù)委員會(huì)委員、南京大學(xué)校長(zhǎng)。

第十三屆全國(guó)人民代表大會(huì)代表。

2018年3月18日，在第十三屆全國(guó)人民代表大會(huì)第一次會(huì)議上，當(dāng)選為第十三屆全國(guó)人民代表大會(huì)常務(wù)委員會(huì)委員。

呂建主要從事軟件方法學(xué)研究，在軟件基礎(chǔ)理論與方法、網(wǎng)構(gòu)軟件方法學(xué)和新型軟件平臺(tái)及其應(yīng)用方面取得系列成果。提出了一種具有模型裂變能力的形式化開(kāi)發(fā)方法，其數(shù)據(jù)分解新機(jī)制可用于大型程序開(kāi)發(fā)的復(fù)雜性控制。研究了開(kāi)放環(huán)境下軟件系統(tǒng)的范型、方法與技術(shù)等問(wèn)題，提出了基于Agent的網(wǎng)構(gòu)軟件方法學(xué)，探索了面向Internet軟件方法學(xué)研究的新途徑。發(fā)展了開(kāi)放環(huán)境下的軟件協(xié)同技術(shù)，主持研制了新型軟件協(xié)同平臺(tái)，可為開(kāi)放、動(dòng)態(tài)、多變環(huán)境下應(yīng)用系統(tǒng)的開(kāi)發(fā)與運(yùn)行提供支撐。

呂建以探索建立新型軟件方法學(xué)作為重大科學(xué)問(wèn)題導(dǎo)向，長(zhǎng)期堅(jiān)持該領(lǐng)域的基礎(chǔ)研究、技術(shù)創(chuàng)新與應(yīng)用實(shí)踐，在軟件基礎(chǔ)理論與方法、網(wǎng)構(gòu)軟件方法學(xué)、新型軟件平臺(tái)及應(yīng)用方面取得了系統(tǒng)性和創(chuàng)新性的成果，為中國(guó)軟件事業(yè)的發(fā)展作出了重要貢獻(xiàn)。

作為學(xué)術(shù)帶頭人，呂建教授的“面向Internet的軟件方法與技術(shù)”團(tuán)隊(duì)于2005年和2007年分別入選“教育部創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)”和“國(guó)家自然科學(xué)基金委創(chuàng)新研究群體”；由他擔(dān)任主任的“計(jì)算機(jī)軟件新技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室”于2007年與2012年連續(xù)兩次獲評(píng)信息領(lǐng)域優(yōu)秀國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。

先后承擔(dān)國(guó)家973重大基礎(chǔ)研究計(jì)劃、國(guó)家863高技術(shù)、國(guó)家科技攻關(guān)計(jì)劃、國(guó)家攀登計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金和國(guó)際合作等項(xiàng)目20余項(xiàng)；

在國(guó)內(nèi)外重要刊物與會(huì)議論文集上發(fā)表論文100余篇，研究成果被多國(guó)研究人員多次引用；

獲國(guó)家教委科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)2項(xiàng)（排名第二），二等獎(jiǎng)1項(xiàng)，江蘇省科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)1項(xiàng)；

1990年 被授予“做出突出貢獻(xiàn)的中國(guó)博士學(xué)位獲得者”稱號(hào)；

1993年 獲霍英東青年教師獎(jiǎng)（研究類）；

1994年 進(jìn)入“國(guó)家教委跨世紀(jì)優(yōu)秀人才計(jì)劃”；

1995年 獲“ 國(guó)家杰出青年科學(xué)基金”資助；

1996年 獲中國(guó)青年科技獎(jiǎng)；

1997年 進(jìn)入國(guó)家“ 百千萬(wàn)人才工程”（第一、二層次）；

1997年 進(jìn)入江蘇省“333”人才培養(yǎng)工程第二層次，并于2002年轉(zhuǎn)入第一層次；

1999年 獲中創(chuàng)軟件人才獎(jiǎng)；

2000年 被南京大學(xué)聘為特聘教授；

2001年 獲國(guó)家科技部“863計(jì)劃十五周年”先進(jìn)個(gè)人稱號(hào)；

2003年度 教育部提名 國(guó)家科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)自然科學(xué)一等獎(jiǎng)（第一完成人）；

2006年 獲“江蘇省有突出貢獻(xiàn)中青年專家稱號(hào)”；

2006年度 國(guó)家科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)（第一完成人）；

2006年 作為團(tuán)隊(duì)帶頭人帶領(lǐng)計(jì)算機(jī)軟件新技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的“面向Internet的軟件方法與技術(shù)”研究團(tuán)隊(duì)獲得教育部創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)稱號(hào)；

2011年 獲得中科院院士信息技術(shù)科學(xué)部（共36人）提名候選院士；

2013年 當(dāng)選為 中國(guó)科學(xué)院信息技術(shù)科學(xué)部 院士。

兼任國(guó)家863高技術(shù)計(jì)劃信息領(lǐng)域?qū)＜医M成員（十一五），

國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)計(jì)算機(jī)學(xué)科評(píng)議組成員，

教育部科學(xué)技術(shù)委員會(huì)信息學(xué)部委員，

聯(lián)合國(guó)大學(xué)國(guó)際計(jì)算機(jī)軟件研究所Board Member，

中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)系統(tǒng)軟件專業(yè)委員會(huì)主任，

江蘇省自然科學(xué)基金委員會(huì)信息學(xué)科組組長(zhǎng)。

江蘇省黨外知識(shí)分子聯(lián)誼會(huì)會(huì)長(zhǎng)；

從2004年開(kāi)始擔(dān)任一屆知聯(lián)會(huì)理事、二屆知聯(lián)會(huì)副會(huì)長(zhǎng)；

“核高基”科技重大專項(xiàng)總體專家組成員；?

自然科學(xué)基金委信息學(xué)部專家咨詢委員會(huì)委員；?

國(guó)務(wù)院學(xué)位委員會(huì)計(jì)算機(jī)學(xué)科評(píng)議組成員；

計(jì)算機(jī)科學(xué)技術(shù)教學(xué)指導(dǎo)委員會(huì)副主任；

中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)副理事長(zhǎng)，中國(guó)計(jì)算機(jī)學(xué)會(huì)軟件工程專業(yè)委員會(huì)主任。

第二屆高等學(xué)�？茖W(xué)研究?jī)?yōu)秀成果獎(jiǎng)（科學(xué)技術(shù)）獎(jiǎng)勵(lì)委員會(huì)委員。