少年時期的侯恂，聰穎悟性高，鄉(xiāng)民們都稱他為神童。長大以后特別愛好學習《尚書》，凡學過的東西過目不忘。他還特別精通書法，書法造詣也很高。 18歲登錄景泰七年（ 1456）的鄉(xiāng)榜，成化二年（ 1466）考中進士。

歷任戶部主事、山東按察司僉事、督運京畿軍儲、湖廣按察副使、山東按察使。在外執(zhí)政十余年，秉理執(zhí)法，風紀凜然。提升為都察院右僉都御史后，被朝廷臨時派遣到山西大同巡視和監(jiān)督地方軍政和民政。期間，嚴厲整頓軍隊官兵和地方官吏，威名遠揚、震動邊塞。轉任副都御史后，又被朝廷臨時派遣山西做巡撫。期間，整治山西成績顯著，社會反響甚好，功勞特別大，受到朝廷褒賜。隨后，被朝廷召回安排到舊都南京任督操江一職，領導管理上下江防事務。

侯恂在南京都察院副都察御史任上退休后卒，歸葬故里。孝宗皇帝派遣朝廷官員祭拜他。弘治十一年（ 1498） 十二月十六日，祭官陜西布政使司左參政李贊宣讀的祭文 《御祭致仕南京都察院副都御史侯恂文》：“惟爾性資敦樸，器識通明。發(fā)身賢料，擢官郎署。歷躋憲長，振肅大藩。超佐都臺，巡撫邊徼。才猷茂著，資望薦深。尋轉留都，遂求歸休。方娛暮景，胡遽云亡！訃音來聞，特賜以祭。爾靈不昧，尚可來承�！� 侯恂墓在縣城北門外五里許，有御祭文、誥敕兩碑。一碑陰有康熙第三十九子寫的墓記。

弘治七年（ 1494） 四月初十日誥文如下： 《封右僉都御史候恂 》：“國家建都察院，以糾察百僚，其品秩與六部等，所以重綱紀之司，付耳目之寄也。為長貳者，非德剛介廉慎之士，曷克稱焉。咨爾都察院，右僉都御史候恂，登名進士，擢屬司徒，迨遷佐于外臺，累進官于掌憲，才猷茂展，聞望益隆。轉職中丞，撫巡邊地，揚軍威于萬里，肅風裁于一方。勞勚滋深，寵褒宜賜。茲用進階中憲大夫，賜之誥命，以為爾榮。其益堅乃志，勵乃操。振綱紀而馭眾，修政事以攘夷。務使奸宄潛銷，邊方安靖，民懷吏畏，予則汝嘉。欽哉！ ”

侯恂在南京都察院副都察御史任上退休后卒，歸葬故里。孝宗皇帝派遣朝廷官員祭拜他。弘治十一年（ 1498） 十二月十六日，祭官陜西布政使司左參政李贊宣讀的祭文 《御祭致仕南京都察院副都御史侯恂文》：“惟爾性資敦樸，器識通明。發(fā)身賢料，擢官郎署。歷躋憲長，振肅大藩。超佐都臺，巡撫邊徼。才猷茂著，資望薦深。尋轉留都，遂求歸休。方娛暮景，胡遽云亡！訃音來聞，特賜以祭。爾靈不昧，尚可來承。” 侯恂墓在縣城北門外五里許，有御祭文、誥敕兩碑。一碑陰有康熙第三十九子寫的墓記。