967年起，先后在杭州市人民中學(xué)，杭州市第四中學(xué)任教。1978年，考取山東大學(xué)數(shù)學(xué)系研究生，在著名數(shù)論專家潘承洞院士的指導(dǎo)下攻讀解析數(shù)論。1980年，因成績(jī)優(yōu)異，提前畢業(yè)，任教于山東大學(xué)數(shù)學(xué)系。1981年，去英國(guó)劍橋大學(xué)，在國(guó)際著名超越數(shù)論權(quán)威A. Baker教授的指導(dǎo)下進(jìn)行超越數(shù)論的研究。1983年5月，獲山東大學(xué)理學(xué)博士學(xué)位。1984年起，歷任山東大學(xué)數(shù)學(xué)系副主任、副教授、山東省青年聯(lián)合會(huì)副主席、山東省數(shù)學(xué)會(huì)常務(wù)理事等職。1987年起任教授，在杭州師范學(xué)院工作，曾任杭州師范學(xué)院數(shù)學(xué)系主任、副院長(zhǎng)、副院級(jí)巡視員；2002年起，任衢州職業(yè)技術(shù)學(xué)院院長(zhǎng)；曾任中國(guó)優(yōu)選法統(tǒng)籌法與經(jīng)濟(jì)數(shù)學(xué)研究會(huì)理事、浙江省應(yīng)用數(shù)學(xué)研究會(huì)副理事長(zhǎng)、杭州市數(shù)學(xué)會(huì)理事長(zhǎng)等職。1990年與1995年，兩次應(yīng)邀赴美國(guó)南伊利諾大學(xué)、內(nèi)華達(dá)州立大學(xué)（拉斯維加斯）、加利福尼亞州立大學(xué)等學(xué)校訪問(wèn)、講學(xué)。1986年起擔(dān)任 《Mathemat¬ical　 Reviews》雜志評(píng)論員。是第五、六、七、八屆全國(guó)密碼學(xué)會(huì)議程序委員會(huì)委員，2002年國(guó)際數(shù)學(xué)家大會(huì)數(shù)學(xué)教育分會(huì)程序委員會(huì)委員，1997年與2000年兩屆國(guó)際數(shù)學(xué)教育學(xué)術(shù)研討會(huì)（杭州）學(xué)術(shù)委員會(huì)主席。 　于秀源教授主要從事解析數(shù)論、超越數(shù)論和密碼學(xué)的研究，1994年以來(lái)，也從事數(shù)學(xué)教育的研究。已在《中國(guó)科學(xué)》等國(guó)內(nèi)外重要學(xué)術(shù)期刊上發(fā)表論文120余篇，出版專著及教材8部。已五次主持國(guó)家自然科學(xué)基金會(huì)資助的研究項(xiàng)目，五次主持浙江省自然科學(xué)基金會(huì)資助的研究項(xiàng)目，并多次主持教育部、浙江省教育廳科研和教改項(xiàng)目，取得很好的成果。

于秀源博士一直在教學(xué)第一線工作，培養(yǎng)了一批優(yōu)秀的數(shù)學(xué)和密碼學(xué)人才，許多已成為博士生導(dǎo)師，學(xué)術(shù)帶頭人，其中有享譽(yù)國(guó)內(nèi)外的密碼學(xué)專家王小云等。

1990年獲“浙江省優(yōu)秀教師”榮譽(yù)稱號(hào)。1991年獲國(guó)家教委、國(guó)務(wù)院學(xué)位辦公室授予的“做出突出貢獻(xiàn)的中國(guó)博士學(xué)位獲得者”榮譽(yù)稱號(hào)。1993年獲“國(guó)家高師院校教師獎(jiǎng)”（曾憲梓獎(jiǎng)）二等獎(jiǎng)。四次獲浙江省教育廳科技進(jìn)步獎(jiǎng)；二次獲浙江省優(yōu)秀教學(xué)成果獎(jiǎng)，以及其他獎(jiǎng)項(xiàng)。2002年獲中共中央辦公廳“黨政密碼科技進(jìn)步獎(jiǎng)”一等獎(jiǎng)。1992年起享受政府特殊津貼