1904年9月25日，出生于北京。其祖父在北京開設(shè)金店，后經(jīng)營虧損倒閉。其父系小職員，靠微薄收入維持全家人的生活。他不幸5歲喪父，8歲喪母。其后，他和一個長兄及一個小弟分養(yǎng)在兩位舅父家中。他住在二舅父（普通公務(wù)員）家里。裘祖源8歲進私塾，10歲時考入中華圣公會開辦的崇德學(xué)堂，連續(xù)學(xué)習(xí)了8年。

1922年，18歲時高中畢業(yè)。

1923年，他從中華圣公會得到助學(xué)金并考入了北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院預(yù)科，1925年轉(zhuǎn)燕京大學(xué)醫(yī)預(yù)科。

1926年，畢業(yè)，獲理學(xué)士學(xué)位。

1931年，北平協(xié)和醫(yī)學(xué)院畢業(yè)，獲醫(yī)學(xué)博士學(xué)位。

1931年至1933年，任北平協(xié)和醫(yī)院內(nèi)科住院醫(yī)師。

1933年6月，按中華圣公會發(fā)給助學(xué)金的規(guī)定，被派到山西大同中華圣公會辦的首善醫(yī)院的內(nèi)科工作了兩年。他在這4年的臨床工作中，每天接診很多結(jié)核�。ㄋ追Q癆病）患者，且多為晚期不易治愈的，加上自己的母親和舅父先后死于癆病，便開始萌發(fā)了獻身防癆事業(yè)的念頭。

1933年至1935年，任山西省大同首善醫(yī)院內(nèi)科醫(yī)師。

1935年7月，裘祖源回到協(xié)和醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生科任助教，并到公共衛(wèi)生科教學(xué)示范區(qū)（現(xiàn)北京市東城區(qū)東南部）——北平市第一衛(wèi)生事務(wù)所任職。

1935年至1937年，任北平協(xié)和醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生科助教，兼北平市第一衛(wèi)生事務(wù)所防癆門診處（后改防癆科）醫(yī)師。

1937年至1939年，留學(xué)美國明尼蘇達州立醫(yī)學(xué)院，并到美國東部、英國、法國、瑞士、意大利考察結(jié)核防治工作。

1939年底，回國后，襲祖源仍到協(xié)和醫(yī)學(xué)院，任公共衛(wèi)生系襄教授，主要從事結(jié)核病的防治工作。

1939年至1949年，任北平協(xié)和醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生系襄教授，兼任北平市第一衛(wèi)生事務(wù)所防癆科主任、所長。

1944年，與郭德隆等一起發(fā)起創(chuàng)辦平津防癆協(xié)會。

1948年5月1日，成立平津防癆協(xié)會北平門診部，任門診部主任。

1946年至1948年，任北平結(jié)核病防治院院長。

1947年至1949年，任北平協(xié)和醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生系主任，兼圖書館館長、協(xié)和醫(yī)院院長。

1948年5月1日，平津防癆協(xié)會門診部在北平北池子成立，襲祖源任門診部主任，開展群眾防癆宣傳和防癆門診工作。

1949年中華人民共和國成立后，裘祖源任協(xié)和醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生系教授兼教育長。由于人民政府重視防癆工作，他十分振奮，積極獻計獻策，協(xié)助制定有關(guān)防治條例和研究規(guī)劃，協(xié)助籌建中央結(jié)核病研究所（北京市結(jié)核病胸部腫瘤研究所前身）。

1950年至1955年，任北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生系教授兼教育長。

1954年，他服從工作需要，轉(zhuǎn)入該研究所，任第一副所長兼流行病學(xué)研究室主任。在他親自領(lǐng)導(dǎo)、指導(dǎo)下該所進行了不少有價值的工作，獲得多項重大科研成果。

1950年至1986年，任中華醫(yī)學(xué)會結(jié)核病科學(xué)會副主任委員、主任委員、名譽主任委員，中國防癆協(xié)會總干事、副會長、顧問。

1950年至1954年，任《防癆通訊》主編。

1951年至1955年，任北京市防癆委員會副主任委員。

1953年至1988年，任《中華結(jié)核病科雜志》 （后改《中華結(jié)核和呼吸雜志》）總編輯、名譽總編輯。

1955年至1988年，中央結(jié)核病研究所（現(xiàn)名北京市結(jié)核病胸部腫瘤研究所）第一副所長、顧問，兼流行病學(xué)研究室主任。

1980年至1988年，任全國結(jié)核病防治研究咨詢組副組長。

1988年11月15日，裘祖源在北京逝世，終年84歲。

在霍爾和袁貽瑾（當(dāng)時為公共衛(wèi)生科主任）的倡議下，動用了在民間捐募的結(jié)核病院籌建基金，在衛(wèi)生所內(nèi)創(chuàng)立了防癆門診處，由霍爾和裘祖源主持，開展防癆工作。這是結(jié)核病在中國第一次與公共衛(wèi)生（預(yù)防醫(yī)學(xué)）工作聯(lián)系起來。裘祖源不定期地到西山福壽嶺霍普金斯療養(yǎng)院（后改名同仁療養(yǎng)院）和香山療養(yǎng)院（紅十字會辦的）以及其后由他創(chuàng)立的北平結(jié)核病院住院部巡診。

裘祖源酷愛讀書，勤于寫作，除撰寫大量講義、講稿外，先后公開發(fā)表論文44篇，還與范秉哲主編《結(jié)核病學(xué)》一書，并為《內(nèi)科理論與實踐》一書撰寫了呼吸道疾病部分。他還積極參與群眾性學(xué)術(shù)團體工作，先后任中國防癆協(xié)會總干事、副理事長、顧問，中華醫(yī)學(xué)會結(jié)核病科學(xué)會副主任委員、主任委員、名譽主任委員， 《中華結(jié)核病科雜志》總編輯、名譽總編輯，北京市防癆委員會副主任委員等職務(wù)。

20世紀(jì)40年代以前，結(jié)核病尚無特效的治療藥物，當(dāng)時人們得了肺結(jié)核就象被宣判了死刑一樣。那時，得此病的人很多，防不勝防，治不勝治，且此病常與貧困相伴隨，即使是較輕的病人往往因無療養(yǎng)條件而演變成重癥，醫(yī)生苦無辦法。對這一事關(guān)社會、經(jīng)濟的重大問題，無不望之興嘆。裘祖源和他的同道知難而上，在北平市第一衛(wèi)生事務(wù)所內(nèi)創(chuàng)立了防癆門診處，參考國外的經(jīng)驗，遵循公共衛(wèi)生的“醫(yī)療服務(wù)要適應(yīng)社會實際”和“對傳染病要抓流行規(guī)律和傳染源管理”等公共衛(wèi)生的原則，結(jié)合中國的實際狀況，探索、開拓了在中國防治結(jié)核?耐揪叮涸謔痙肚?鴆絞敵忻浚薄?襯曜?一次集體X線肺部健康檢查，以早期發(fā)現(xiàn)，早期治療；改變過去那種“求醫(yī)給治，不求不管”的狀況，把已發(fā)現(xiàn)的病人登記管理起來；加強宣傳教育，告訴群眾結(jié)核病是可以預(yù)防的，若能早期診斷、早期治療是可以治愈的；在家治療者由公衛(wèi)護士定期訪視，指導(dǎo)家庭隔離消毒工作，以防傳染他人；要求病人按期來門診復(fù)查，到期不來則去人、去信催促；動員密切接觸病人的人作X線肺部健康檢查等等。在創(chuàng)立防癆門診處初期階段，裘祖源和何觀清、朱宗堯、蔡如升等先后用相當(dāng)多的時間對衛(wèi)生示范區(qū)內(nèi)部分嬰幼兒、小學(xué)生、中學(xué)生、大學(xué)生、孕婦、各行從業(yè)人員以及西城的輔仁大學(xué)、西北郊的燕京大學(xué)的師生員工和河北省定縣的部分農(nóng)村居民進行結(jié)核菌素試驗和X線肺部健康檢查相結(jié)合的流行病學(xué)調(diào)查研究。他們歷經(jīng)兩年時間，共檢查21000多人，明確了30年代北平和河北省定縣一帶的結(jié)核病疫情：15歲的兒童結(jié)核感染率高達80%以上；大學(xué)生的患病率在5%以上；疫情最高的是理發(fā)業(yè)從業(yè)人員，患病率在19．2%—27．3%之間；農(nóng)村居民的感梁率和患病率遠低于城鎮(zhèn)居民。這一系列數(shù)據(jù)首次為中國分析、比較結(jié)核病疫情變化提供了基線資料。因為這是對人群的健康檢查，發(fā)現(xiàn)的病人多數(shù)是早期的，即使在尚無特效藥的年代里，早期肺結(jié)核病人休息幾個月，甚至有的可以照常工作、學(xué)習(xí)，只要勞逸結(jié)合，注意充足營養(yǎng)，必要時給予人工氣胸、人工氣腹、膈神經(jīng)壓榨術(shù)萎陷治療，也可以治愈。

裘祖源十分重視結(jié)核病人的密切接觸者的檢查。因為與患者接觸密切的人，容易感染、發(fā)病，但是若能及時檢查，可以早期發(fā)現(xiàn)，早期治療，一般多會治愈。

中華人民共和國成立后，人民政府關(guān)心群眾疾苦，重視防癆工作，采取有重點、有部署、先城市后農(nóng)村、先團體后居民的方針。這與裘祖源教授的積極建議和提供的寶貴經(jīng)驗有關(guān)。裘祖源領(lǐng)導(dǎo)的中央結(jié)核病研究所流行病學(xué)研究室的工作，多年來一直樂于采用典型調(diào)查和在實驗地區(qū)有系統(tǒng)地、不斷地開展防治工作的方法，成效顯著，有多項突出的成果，如：對北京市東城區(qū)城市居民、河北省涿縣農(nóng)民、青海少數(shù)民族等三項結(jié)核病流行病學(xué)調(diào)查，不作結(jié)核菌素試驗直接皮上劃痕接種卡介苗的研究，紅星公社農(nóng)村地區(qū)控制結(jié)核病流行的研究等，分別獲得北京市科技成果獎。

晚年，他任全國結(jié)核病防治咨詢組副組長期間，積極參與結(jié)核病防治決策的論證，積極參與籌劃1979年和1984/1985年兩次全國結(jié)核病流行病學(xué)抽樣調(diào)查，在這些工作中，都作出了寶貴的貢獻。

在中華人民共和國成立以前，裘祖源等人在北平市第一衛(wèi)生事務(wù)所開拓的防癆工作，雖然取得成功，但只是一個示范區(qū)，效益有限。他們根據(jù)多年的親身體會，認(rèn)識到要消滅廣泛流行的結(jié)核病必須聯(lián)合社會一切力量共同防治。1944年，由裘祖源和天津郭德隆等發(fā)起成立了平津防癆協(xié)會。在北平以協(xié)會名義接收了北池子風(fēng)神廟舊址做會址，由裘祖源主持日常工作。當(dāng)時經(jīng)費有限，他開始只在報刊上宣傳防癆知識。1947年，協(xié)會接受了聯(lián)合國救濟總署捐贈的一臺200千伏X線機，又向銀行工商界捐募了一些錢，把風(fēng)神廟舊址加以修理改成門診部。1948年5月1日，平津防癆協(xié)會門診部開業(yè)。這是繼北平市第一衛(wèi)生所防癆科后在北京開設(shè)的第二個結(jié)核病防治專業(yè)機構(gòu)，受到群眾的普遍歡迎。

1948年1月，在上海召開各地防癆協(xié)會代表大會暨中國防癆協(xié)會恢復(fù)大會，裘祖源被選為理事。中華人民共和國成立后，為了加強中國防癆協(xié)會與中央衛(wèi)生部的聯(lián)系，于1951年1月中國防癆協(xié)會由上海遷到北京，裘祖源被委以總干事的重任。他協(xié)助中央衛(wèi)生部組織擬定了結(jié)核病防治工作條例和全國卡介苗接種方案，為中國防癆工作奠定了良好的基礎(chǔ)。他還在北京先后與蔡如升主持舉辦了三期防癆骨干學(xué)習(xí)班和防治所長研究班，為全國各地建立、健全防癆機構(gòu)和推廣卡介苗接種做出了重要貢獻。鑒于中國早期的防癆工作在各地的發(fā)展很不平衡，他親自跑了許多省市做說服動員工作，促進成立了一些地方的防癆協(xié)會和防治機構(gòu)乃至成立三級防癆網(wǎng)。

裘祖源一貫主張，防癆協(xié)會應(yīng)成為與廣大群眾密切聯(lián)系的群眾團體，其主要任務(wù)是把科學(xué)的防癆知識通過各種形式和途徑宣傳給群眾，使之自覺防治結(jié)核病，從而收到事半功倍的效益。

裘祖源自1935年任北平市第一衛(wèi)生事務(wù)所防癆門診處醫(yī)師以來，對來該所實習(xí)的協(xié)和醫(yī)學(xué)院及協(xié)和護士學(xué)校的高年級學(xué)生，對所有在他領(lǐng)導(dǎo)下的單位工作和進修的人員，都一視同仁，諄諄善誘，誨人不倦。他要求大家對結(jié)核病不僅要善于治療，更要善于預(yù)防，善于早期診斷，善于管理病人。

中華人民共和國成立后，他多次受命主持舉辦防癆骨干人員學(xué)習(xí)班，他十分振奮，邀請協(xié)和醫(yī)學(xué)院的專家、教授講授課程，并要求深入淺出、簡捷明快，務(wù)求講深講透，以利于實際應(yīng)用。其后，由于全國防癆工作的蓬勃發(fā)展，對于專業(yè)人員的需求成倍增多，裘祖源和許多同事一起，走出學(xué)府大門，足跡遍及全國各地，不辭辛苦地參加培訓(xùn)在職醫(yī)生或各級醫(yī)務(wù)人員。據(jù)粗略估算，這樣受培訓(xùn)的學(xué)員不下1000人，其中許多人已成為國際間的名教授、名專家，國內(nèi)防癆工作中的骨干。

裘祖源在1952—1956年間，任《防癆通訊》主編，1953—1987年間，任《中華結(jié)核病科雜志》 （現(xiàn)《中華結(jié)核和呼吸雜志》）總編輯。他一直認(rèn)為雜志是個大學(xué)校，是經(jīng)常性的繼續(xù)教育的好教材。因此，他十分重視雜志的質(zhì)量，從不計較報酬，不計時間，常在夜晚或節(jié)假日開審稿會議，經(jīng)常審改稿件到深夜。受益于雜志的讀者無從計數(shù)。

1　宋漢英，裘祖源，朱宗堯，蔡如升．北京市大學(xué)學(xué)生患肺結(jié)核病的情形．北京結(jié)核病院論文第1集，1943：13—19．

2　蔡如升，裘祖源，常樹新，朱宗堯．北京市孕婦患肺結(jié)核情形．北京結(jié)核病院論文第1集，1943：3336．

3　蔡如升，裘祖源，朱宗堯．北京市理發(fā)業(yè)及飯館業(yè)之肺結(jié)核病情形．北京結(jié)核病院論文第1集，1943：37—41．

4　宋漢英，裘祖源，蔡如升．北京市澡堂業(yè)之肺結(jié)核病情形．北京結(jié)核病院論文第1集，1943：43—46．

5　裘祖源．近世預(yù)防結(jié)核病之主旨．北京結(jié)核病院論文第1集，1943：47—53．

6　北京結(jié)核病研究所流行病學(xué)研究室（裘祖源等集體）．北京市東城區(qū)趙堂子地段居民肺結(jié)核流行病學(xué)調(diào)查及管理．中國防癆，1959，（2）：3—6．

7　北京結(jié)核病研究所流行病學(xué)研究室（裘祖源等集體）．河北省涿縣幸福人民公社部分地區(qū)結(jié)核病流行病學(xué)調(diào)查．中國防癆，1959（2）：20—23．

8　北京結(jié)核病研究所流行病學(xué)研究室（裘祖源等集體）．青海省少數(shù)民族地區(qū)結(jié)核病流行病學(xué)調(diào)查．北京結(jié)核病研究所1959年學(xué)術(shù)報告會論文摘要，1959：7．

9　北京結(jié)核病研究所流行病學(xué)研究室（裘祖源等集體）．不作結(jié)素試驗直接劃痕接種卡介苗初步報告．中國防癆，1959，（5）：13—14．

10　裘祖源，謝匯江．中學(xué)生對結(jié)核菌素敏感度的調(diào)查分析，中華醫(yī)學(xué)會北京分會結(jié)核病科學(xué)會論文摘要，1964：5．

11　李樹森，裘祖源，肖成志，徐瑞興．以消滅傳染源為主要目的的不住院化療效果的初步分析．中國防癆雜志，1963，4（2）：76．

12　范秉哲，裘祖源主編．結(jié)核病學(xué)．北京：人民衛(wèi)生出版社，1964．

13　裘祖源，王忠仁，肖成志等．并用異煙肼、氨硫脲不住院治療肺結(jié)核療效觀察報告．中國防癆通訊，1980，（1）：10—13．

14　裘祖源．有關(guān)結(jié)核病流行病學(xué)與防治中的幾個問題．中華結(jié)核和呼吸系疾病雜志，1980，3：35．

15　吳兆儒，裘祖源．紅星公社西紅門分場連續(xù)七年防癆回顧調(diào)查．中華結(jié)核和呼吸系疾病雜志，1984，7：7—9

為了弘揚裘祖源的卓識遠見和50年如一日鍥而不舍地獻身防癆事業(yè)的精神，1984年9月，中國防癆協(xié)會和北京市結(jié)核病胸部腫瘤研究所聯(lián)合舉辦了“祝賀裘祖源教授從事防癆工作50年學(xué)術(shù)報告紀(jì)念會”。會后，出版了紀(jì)念集。